一、品種選擇主要是砧木的選擇
一般選擇高抗根結線蟲病和青枯病的野生選育番茄種，現在國內進行番茄嫁接尚處於實驗階段，要完全抵抗所有青枯病亞種的砧木還沒有，通常只是高抗其中的幾種亞種。所以必須明確種植地番茄青枯病的生理亞種，再選擇相應的砧木。一般採用的方法就是從不同的地區購買多個砧木進行實驗性栽培來確定。接穗可以使用常規品種。
二、砧木、接穗適宜播期劈接法
一般砧木要提前播種7-10天，在一葉一心時將砧木假植到營養杯中。當砧木長到8至l0釐米高，莖粗0.5至0.8釐米即可嫁接，用刀片橫切砧木莖，去掉上部，再由莖中間劈開，向開口縱切1至1.5釐米，然後將接穗苗拔起，保留上片2至3片真葉，用刀片切掉下部，把上部切開處削成楔形，楔形的大小應與砧木切口相當，隨即將接穗插入砧木中，對齊後用夾子固定。在有條件的情況下，接穗可採用番茄母本的植株腋芽，既能節約種子成本，又能提高嫁接成活率，還能提早結果上市期。
三、嫁接苗管理嫁接後要及時
將苗牀充分澆水，蓋上小拱棚密閉。6-7天內不得放風，保持95%以上的空氣溼度。溫度白天20-26℃，夜間16-20℃。防止溫度過高和過低。在溫度過高、陽光強烈的時候要加蓋遮陽網。在低溫時期要用地熱線等人工補充溫度防止植株受到凍害。
嫁接後4-5天要全部遮光，以後每天逐漸增加見光時間。隨着傷口的逐漸癒合，撤掉遮陽網，並揭開兩側塑料薄膜通風，開始通風要小，逐漸加大。通風期間棚內要保持較高的空氣溼度，地面要經常澆水，完全成活後轉入正常管理。成活後及時摘除砧木萌發的側芽，待接口癒合牢固後去掉夾子。
四、定植及初期管理
大棚番茄嫁接栽培的施肥很重要，要求每畝施農家肥5000至6000公斤、蔬菜專用複合肥4O-60公斤。全部施於地面，翻入土壤中混合均勻。每畝栽l800-2000株(大棚)。地溫l5℃以上後開始定植，地膜覆蓋，定植時選晴好天氣，先打孔澆水，再移栽水滲下去後覆上封嚴孔口。注意嫁接時刀口位置要高於廂面一定距離，以防接穗根受到二次污染致病。定植後注意密閉保溫不通風，一週即可緩苗，緩苗後的溫度管理：上午25℃-3O℃，當超過35℃時應適當放風降溫，下午28℃-30℃，低於25℃時要關棚保溫，保持白天20℃以上，夜間l0℃-l5℃。
