消化系統包括消化管和消化腺兩部分。
消化管包括口腔、咽、食管、胃、小腸、大腸和肛門；消化腺包括唾液腺、胃腺、腸腺、胰腺和肝臟。消化腺具有分泌各種消化液的功能，消化液內含有能使食物消化分解的物質叫消化酶，如唾液中的澱粉酶、胃內的胃蛋白酶、胰腺產生的胰澱粉酶等。
消化管主要是由黏膜和平滑肌構成的。隨着消化管壁平滑肌的收縮和放鬆，引起消化管的蠕動，將混有消化液的食物向前推進，通過消化器官進行消化和吸收，最後的食物殘渣形成大便，由肛門排出。
兒童消化管與成人的區別是：兒童消化管的黏膜非常細嫩，血管較多，消化功能較差，因而要特別注意飲食衛生，防止消化不良和發生胃腸道疾病。
此外應注意的是，吃過辣過燙的食物容易燙傷食管壁；吃堅硬的食物如魚刺、碎骨片等易刺破食管黏膜引起炎症；邊吃邊談笑則容易把米粒、黃豆、花生仁等嗆入喉腔或氣管引起劇烈咳嗽，嚴重者甚至造成窒息、死亡。
消化系統運行得正常與否，與牙齒有着很大的關係。牙齒不好就會增加胃腸負擔。兒童時期要經歷一次換牙的生理過程。一般6~7歲時，乳齒便開始脫落（乳齒有20個），隨之慢慢長出恆牙來，12~13歲時全部交換完成。換牙期間，可出現暫時性的牙列不齊，很易嵌塞食物，刺傷牙齦而發炎。有的兒童習慣於張口呼吸使牙齦乾燥，發生增殖性牙齦乳頭肥大，引起咀嚼疼痛。齲齒是兒童最常見的口腔牙病，一般4~8歲是乳齲高發期，11~18歲少年則恆齲多見。
兒童從小應講究口腔衛生，要養成飯後漱口、早晚刷牙的衛生習慣，不吃過冷的食物，不喝過冷的水。要多吃些需要多咀嚼的食物如水果、烤饅頭片等，以利牙齒的正常發育。食物中應少含糖，多含磷、鈣、維生素D等。
相對而言，兒童的腸管比成人的要長些，腸道蠕動也比成人弱，腹肌的推動力更是不足，這些原因造成食物通過比較慢，很容易引起消化不良、便祕、厭食等症狀。
要合理安排進餐時間和營養素的分配，要養成按時進餐的習慣，不偏食、不吃零食、不暴飲暴食。此外，因營養不良而患便祕的兒童要多飲水，多吃粗糧和含膳食纖維多的蔬菜（如芹菜、絲瓜等）。消化管和消化腺的活動都是在神經調節下進行的，因此進食時保持兒童的精神愉快，對促進消化吸收具有非常重要的作用。
