一般兒童強直性脊柱炎患者早晨起牀時背部會感覺僵硬不適，久臥或久坐起立會出現晨僵或疼痛症狀。其次兒童強直性脊柱炎在慢性發病一般呈現爲低熱症狀，體重明顯減輕，全身疲乏，局部肌肉萎縮，多伴有嚴重的外周大關節和中軸關節症狀，以髖關節炎最爲多見。
在急性發病期會出現高熱，高熱症狀呈階段性。不過一般不影響胸廓活動度，呼吸沒有改變。出現反覆性的虹膜炎症狀，這是兒童強直性脊柱炎的典型症狀，早期虹膜炎可以是強直性脊柱炎惟一表示，表示爲單側眼紅、痛、畏光、黑朦等，可以先後累及雙眼，輕重交替呈現，繼續時間一般爲4-6周，虹膜炎一般無後遺症。
兒童強直性脊柱炎是脊椎的骨質、惟間盤、韌帶、肌肉發生病變，進而壓迫、牽引刺激脊髓、脊神經、血管、植物神經從而出現複雜多樣的症狀。像頸椎病、腰椎病的某些症狀還是很相似的。所以一旦誤診，會造成嚴重的後果，甚至嚴重者可能導致癱瘓。
