績效考覈工資被全部扣除是違規的，績效工資是通過考覈員工進行分配的工資。
一、績效全扣合法麼
用人單位可以制定相關工作制度，如果員工有過錯可以扣績效，並不違法。
法律依據：《中華人民共和國勞動法》第六十二條用工單位應當履行下列義務：
（一）執行國家勞動標準，提供相應的勞動條件和勞動保護；
（二）告知被派遣勞動者的工作要求和勞動報酬；
（三）支付加班費、績效獎金，提供與工作崗位相關的福利待遇；
（四）對在崗被派遣勞動者進行工作崗位所必需的`培訓；
（五）連續用工的，實行正常的工資調整機制；
用工單位不得將被派遣勞動者再派遣到其他用人單位。
二、單位剋扣工資該怎麼認定
如果用人單位剋扣或者無故拖欠勞動者的工資，按相關政策規定，用人單位除在規定的時間內全額支付勞動者工資報酬外，還需加發相當於工資報酬２５％的經濟補償金。對“剋扣”一詞，應做進一步的理解：在勞動者已經爲用人單位提供了正常勞動的前提下，用人單位無正當理由扣減勞動者的工資。
三、工資爭議由誰舉證
勞動爭議調解仲裁法第三十九條第二款規定：“勞動者無法提供由用人單位掌握管理的與仲裁請求有關的證據，仲裁庭可以要求用人單位在指定期限內提供。”用人單位在指定期限內不提供的，應當承擔不利後果。
最高人民法院關於審理勞動爭議案件適用法律若干問題的解釋（一）第１３條特明確規定：因用人單位作出的開除、除名、辭退、解除勞動合同、減少勞動報酬、計算勞動者工作年限等決定而發生的勞動爭議，用人單位負舉證責任。
勞動和社會保障部關於確立勞動關係有關事項的通知中規定：“工資支付憑證、社保記錄、招工招聘登記表、報名表、考勤記錄由用人單位負舉證責任”。
用人單位可以制定相關工作制度，如果員工有過錯可以扣績效，並不違法，用工單位應當履行下列義務：執行國家勞動標準，提供相應的勞動條件和勞動保護；
績效考覈工資不可以被全部扣除，績效工資是通過考覈員工進行分配的工資，一般包括指標完成、質量考覈、安全考覈等各方面，應該是獎金部分，不應該與基本工資掛鉤。
績效工資是通過考覈員工進行分配的工資，一般包括指標完成、質量考覈、安全考覈等各方面，應該是獎金部分，不應該與基本工資掛鉤。可以申請勞動仲裁，因勞動報酬引起的勞動爭議是屬於勞動仲裁範疇的。
法律依據：
《中華人民共和國勞動爭議調解仲裁法》 第二條 中華人民共和國境內的用人單位與勞動者發生的下列勞動爭議，適用本法：
（一）因確認勞動關係發生的爭議；
（二）因訂立、履行、變更、解除和終止勞動合同發生的爭議；
（三）因除名、辭退和辭職、離職發生的爭議；
（四）因工作時間、休息休假、社會保險、福利、培訓以及勞動保護髮生的爭議；
（五）因勞動報酬、工傷醫療費、經濟補償或者賠償金等發生的爭議；
（六）法律、法規規定的其他勞動爭議。
公司把績效全部扣完了不合法，勞動者和用人單位建立勞動關係後，用人單位不得非法或變相對勞動者進行罰款，用人單位非法剋扣勞動者的工資屬於違法行爲，企業以罰款條數來扣績效工資是不合法的。
法律依據:
《中華人民共和國勞動法》
第五十條 工資應當以貨幣形式按月支付給勞動者本人。不得剋扣或者無故拖欠勞動者的.工資。
第九十一條 用人單位有下列侵害勞動者合法權益情形之一的，由勞動行政部門責令支付勞動者的工資報酬、經濟補償，並可以責令支付賠償金：(一)剋扣或者無故拖欠勞動者工資的；(二)拒不支付勞動者延長工作時間工資報酬的；(三)低於當地最低工資標準支付勞動者工資的；(四)解除勞動合同後，未依照本法規定給予勞動者經濟補償的。
“扣績效工資”是否違反勞動？
1、“扣”字的全稱是“剋扣”。勞動法中“工資應當以貨幣形按月支付給勞動者本人。不得剋扣或者無故拖欠勞動者的工資”，
2、“不得剋扣”。那麼什麼算“剋扣”？
國家對“剋扣”也有明文規定。 根據國家《工資支付暫行規定的補充規》中第三條的規定：
“扣”係指用人單位無正當理由扣減勞動者應得工資（即在勞動者已提供正常勞動的前提下用人單位按勞動合規定的標準應當支付給勞動者的全部勞動報）。
不包括以下減發工資的情況：
（1）國家的法律、法規中有明確規定的；
（2）依法簽訂的勞動合同中有明確規定的；
（3）用人單位依法制定並經職代會批准的廠規、廠紀中有明確規定的`；
（4）企業工資總與經濟效益相聯繫，經濟效益下浮時，工資必須下浮的（但支付給勞動者工資不得低於當地最低工資標）；
（5）因勞動者請事假等相應減發工資等。
按照上述五條減發工資，就是合規的；除此外，無正當理由扣減勞動者應得工資的，就是違規的。
績效工資是獎金的另一種稱呼，是指單位在基本工資之外額外支付的工資，所以因爲員工工作原因全部扣除績效工資是合理合規的。是否合法應由以下因素決定：
1、關於扣減績效的規定是否經過職代會或者全體職工大會通過，假如沒有，這項規定就不合法。《勞動法》和《勞動合同法》中有規定。
2、你在入職前公司是否告知你關於績效工資如何扣減的規定，假如沒有，這項規定對你來說不合法。《勞動合同法》中有規定。
3、關於扣減職工績效工資是否向職工告知並提出績效改進方案，假如沒有雖然合法但不合理。以上三條若公司有一條沒有做到你就可以向當地勞動仲裁委員會或者法院提起訴訟。
