乳糖不耐受的症狀：腹瀉
嬰幼兒常見症狀爲腹瀉，典型大便爲黃色稀便，帶泡沫及酸臭味。
繼發性乳糖不耐受引起腹瀉，母乳或者奶粉爲主食的兒童一旦腹瀉，會較長時間也不好轉，往往需要換用無乳糖奶粉後，腹瀉才能慢慢好轉。
乳糖不耐受的症狀：尿布疹
由幹乳糖不耐受，喝奶後，奶在嬰幼兒體內無法被完全分解、消化、吸收滯留在腸腔內，在細菌的作用下形成各種有害物質，引起腸道菌羣失調，引發腸胃問題。
注意：
長期乳糖不耐易導致小兒難治癒的慢性腹瀉，部分患兒會誘發尿布疹。
乳糖不耐受的症狀：發育遲緩
乳糖不耐影響奶中的各種礦物質如鈣、鐵、磷的吸收，造成寶寶缺鈣、缺鋅、缺鐵和貧血症狀等。乳糖不耐也會造成奶中維生素、蛋白質等嬰幼兒生長髮育必須物質難以被患兒消化、吸收，影響小兒的腦發育，
注意：
嚴重的乳糖不耐受還可出現水電解質、酸鹼平衡紊亂，危及生命。
乳糖不耐受的症狀：其他
部分患兒可因腸功能紊亂出現便祕，還可有頭痛、注意力不集中、記憶力下降、乏力、肌肉和關節疼痛、心律不齊、口腔潰瘍、瘙癢、各種過敏反應（如溼疹、哮喘）等全身症狀。
